Это одна из наиболее закрытых башен — с глухими мощными стенами и почти полным отсутствием окон. Название указывает на ее назначение: здесь хранился арсенал обители.

Внутри, на деревянных перекрытиях, разделявших пространство на ярусы, размещались запасные пищали, мечи, ядра и, главное, бочки с порохом. Малое количество окон снижало риск случайного попадания искры. Перекрытия между ярусами конструировались так, чтобы в случае взрыва на одном уровне огонь не перекинулся на другие.

В мирное время здесь же ремонтировали поврежденное снаряжение — башня служила миниатюрным военным заводом. В XVII веке Пафнутьев-Боровский монастырь обладал одним из крупнейших частных арсеналов в Русском государстве, и Оружейную башню возводили по особому государеву указу как надежное хранилище.